文化研究所由16名研究人员组成，主要针对海峡两岸宗教、民间信仰、族群文化以及台湾政要进行发掘与研究，揭示中华文化与台湾族群文化的源流关系，增强包括台湾民众在内的两岸人民的凝聚力和民族文化的认同感。